Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LONRF3Q496Y0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms