Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms