Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms