Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM187BQ17R55 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms