Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACKR1Q16570 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms