Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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