Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPTX1Q15818 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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