Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SF3B3Q15393 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms