Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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