Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

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Length 2,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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PCM1Q15154 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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PCM1Q15154 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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PCM1Q15154 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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PCM1Q15154 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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PCM1Q15154 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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PCM1Q15154 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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PCM1Q15154 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PCM1Q15154 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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