Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms