Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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