Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB39AQ14964 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms