Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIXQ14938 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
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