Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
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