Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms