Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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