Protein–RNA interactions for Protein: Q14517

FAT1, Protocadherin Fat 1, humanhuman

Predictions only

Length 4,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT1Q14517 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
FAT1Q14517 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC12□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC12□□□□□ -0.49
FAT1Q14517 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms