Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBM39Q14498 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBM39Q14498 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBM39Q14498 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBM39Q14498 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RBM39Q14498 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBM39Q14498 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBM39Q14498 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RBM39Q14498 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBM39Q14498 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBM39Q14498 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBM39Q14498 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBM39Q14498 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBM39Q14498 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBM39Q14498 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBM39Q14498 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBM39Q14498 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBM39Q14498 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms