Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE1CQ14123 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms