Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms