Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA1SQ13698 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
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