Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
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