Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C1orf61Q13536 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms