Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
BFSP2Q13515 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BFSP2Q13515 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BFSP2Q13515 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BFSP2Q13515 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
BFSP2Q13515 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BFSP2Q13515 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BFSP2Q13515 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BFSP2Q13515 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BFSP2Q13515 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BFSP2Q13515 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BFSP2Q13515 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BFSP2Q13515 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BFSP2Q13515 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BFSP2Q13515 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BFSP2Q13515 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BFSP2Q13515 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BFSP2Q13515 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BFSP2Q13515 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BFSP2Q13515 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BFSP2Q13515 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BFSP2Q13515 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BFSP2Q13515 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BFSP2Q13515 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BFSP2Q13515 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BFSP2Q13515 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BFSP2Q13515 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BFSP2Q13515 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BFSP2Q13515 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BFSP2Q13515 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BFSP2Q13515 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BFSP2Q13515 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BFSP2Q13515 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BFSP2Q13515 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BFSP2Q13515 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BFSP2Q13515 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BFSP2Q13515 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BFSP2Q13515 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BFSP2Q13515 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BFSP2Q13515 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BFSP2Q13515 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BFSP2Q13515 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BFSP2Q13515 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BFSP2Q13515 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BFSP2Q13515 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BFSP2Q13515 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BFSP2Q13515 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BFSP2Q13515 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BFSP2Q13515 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BFSP2Q13515 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
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