Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
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