Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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