Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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ITGB3BPQ13352 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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ITGB3BPQ13352 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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