Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
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SP140Q13342 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SP140Q13342 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SP140Q13342 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SP140Q13342 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SP140Q13342 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SP140Q13342 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SP140Q13342 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SP140Q13342 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SP140Q13342 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SP140Q13342 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SP140Q13342 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SP140Q13342 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SP140Q13342 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SP140Q13342 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SP140Q13342 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SP140Q13342 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SP140Q13342 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SP140Q13342 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SP140Q13342 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SP140Q13342 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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SP140Q13342 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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SP140Q13342 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SP140Q13342 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SP140Q13342 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SP140Q13342 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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SP140Q13342 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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SP140Q13342 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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SP140Q13342 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SP140Q13342 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SP140Q13342 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SP140Q13342 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SP140Q13342 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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SP140Q13342 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SP140Q13342 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SP140Q13342 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SP140Q13342 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SP140Q13342 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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SP140Q13342 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SP140Q13342 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SP140Q13342 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SP140Q13342 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SP140Q13342 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SP140Q13342 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SP140Q13342 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SP140Q13342 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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