Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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