Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIGQ13278 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIGQ13278 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIGQ13278 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIGQ13278 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RIGQ13278 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIGQ13278 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIGQ13278 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIGQ13278 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIGQ13278 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIGQ13278 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIGQ13278 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIGQ13278 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIGQ13278 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIGQ13278 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIGQ13278 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIGQ13278 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIGQ13278 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIGQ13278 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIGQ13278 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIGQ13278 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIGQ13278 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RIGQ13278 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIGQ13278 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIGQ13278 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIGQ13278 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIGQ13278 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIGQ13278 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIGQ13278 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIGQ13278 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIGQ13278 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIGQ13278 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIGQ13278 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIGQ13278 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIGQ13278 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIGQ13278 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIGQ13278 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIGQ13278 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIGQ13278 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIGQ13278 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIGQ13278 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIGQ13278 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIGQ13278 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIGQ13278 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIGQ13278 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIGQ13278 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIGQ13278 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIGQ13278 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RIGQ13278 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RIGQ13278 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RIGQ13278 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RIGQ13278 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms