Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
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