Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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