Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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