Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX3Q13185 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
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