Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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