Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 PAK4-207ENST00000597766 380 ntTSL 318.41■□□□□ 0.542e-6■■■■□ 21.4
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TARDBPQ13148 MED25-204ENST00000593636 1012 ntTSL 218.26■□□□□ 0.512e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.52e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.372e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 RNF111-208ENST00000559757 541 ntTSL 416.85■□□□□ 0.292e-6■■■■□ 21.4
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TARDBPQ13148 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.212e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 NUMA1-213ENST00000537217 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)16.34■□□□□ 0.212e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 AP003108.2-207ENST00000544880 591 ntTSL 416.04■□□□□ 0.162e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.092e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 MED25-207ENST00000595185 760 ntTSL 1 (best)15.59■□□□□ 0.092e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.082e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TBCE-206ENST00000482230 1050 ntTSL 515.46■□□□□ 0.072e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.052e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 ELF4-203ENST00000434609 406 ntTSL 314.99□□□□□ -0.012e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.022e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.072e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.072e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 DGAT1-205ENST00000527885 605 ntTSL 314.48□□□□□ -0.092e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.092e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.132e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.132e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 BAGE2-201ENST00000470054 1891 ntTSL 1 (best)14.15□□□□□ -0.142e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.142e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.212e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.212e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 DGAT1-203ENST00000524965 1336 ntTSL 513.65□□□□□ -0.222e-6■■■■□ 21.4
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TARDBPQ13148 RPN2-203ENST00000373632 1073 ntTSL 513.3□□□□□ -0.282e-6■■■■□ 21.4
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TARDBPQ13148 NUMA1-203ENST00000366394 539 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.23□□□□□ -0.292e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 NUMA1-231ENST00000546131 280 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.18□□□□□ -0.32e-6■■■■□ 21.4
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TARDBPQ13148 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.312e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.322e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.332e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 CARS-206ENST00000465240 658 ntTSL 213□□□□□ -0.332e-6■■■■□ 21.4
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TARDBPQ13148 BBX-215ENST00000449335 675 ntTSL 512.84□□□□□ -0.352e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 STK40-203ENST00000373130 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.382e-6■■■■□ 21.4
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TARDBPQ13148 KIF13A-201ENST00000259711 5941 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.412e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.412e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.422e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 CARS-201ENST00000278224 2491 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.492e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TRAPPC9-203ENST00000517667 518 ntTSL 311.99□□□□□ -0.492e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 MED25-209ENST00000612791 881 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.52e-6■■■■□ 21.4
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TARDBPQ13148 CARS-202ENST00000380525 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.542e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 PPP2R5C-224ENST00000556946 735 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.582e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 NUMA1-218ENST00000540843 1969 ntTSL 211.2□□□□□ -0.622e-6■■■■□ 21.4
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TARDBPQ13148 NUMA1-202ENST00000358965 7227 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.642e-6■■■■□ 21.4
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TARDBPQ13148 KIF13A-213ENST00000636847 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.832e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 NUMA1-214ENST00000537905 598 ntTSL 39.73□□□□□ -0.852e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 BBX-217ENST00000456419 871 ntTSL 59.66□□□□□ -0.862e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 ARPP19-203ENST00000561971 799 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.872e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 ARPP19-212ENST00000569281 661 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.47□□□□□ -0.892e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 RPN2-207ENST00000462163 712 ntTSL 39.19□□□□□ -0.942e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 AP003108.2-208ENST00000543044 883 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.942e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 KIF13A-204ENST00000378826 5747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.952e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 ARPP19-209ENST00000567669 745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.962e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 NUMA1-201ENST00000351960 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.972e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 ARPP19-213ENST00000569723 550 ntTSL 4 BASIC8.73□□□□□ -1.012e-6■■■■□ 21.4
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TARDBPQ13148 AP003108.2-201ENST00000544025 563 ntTSL 48.37□□□□□ -1.072e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 BBX-202ENST00000402163 1586 ntTSL 58.23□□□□□ -1.092e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 ELF4-202ENST00000335997 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.112e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 NUMA1-232ENST00000613205 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.112e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 ENPP3-205ENST00000427707 1536 ntTSL 1 (best)7.81□□□□□ -1.162e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 BBX-207ENST00000416476 2178 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.242e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TRAPPC9-207ENST00000520532 560 ntTSL 57.27□□□□□ -1.252e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 RPN2-205ENST00000456102 791 ntTSL 37.21□□□□□ -1.262e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 DGAT1-202ENST00000524844 401 ntTSL 37.19□□□□□ -1.262e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.282e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 BBX-209ENST00000427402 959 ntTSL 56.9□□□□□ -1.32e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.312e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 BBX-218ENST00000456817 581 ntTSL 36.74□□□□□ -1.332e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.342e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 BBX-225ENST00000485939 555 ntTSL 46.68□□□□□ -1.342e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.352e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 ENPP3-206ENST00000470930 550 ntTSL 56.28□□□□□ -1.42e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.462e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 ENPP3-207ENST00000494023 632 ntTSL 35.92□□□□□ -1.462e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 NF1-215ENST00000493220 5691 ntTSL 25.9□□□□□ -1.462e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 NF1-205ENST00000456735 7787 ntTSL 55.74□□□□□ -1.492e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.492e-6■■■■□ 21.4
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