Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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CALCOCO2Q13137 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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CALCOCO2Q13137 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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CALCOCO2Q13137 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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CALCOCO2Q13137 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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