Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC30■■■□□ 2.39
TROQ12816 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TROQ12816 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TROQ12816 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
TROQ12816 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
TROQ12816 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
TROQ12816 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC30■■■□□ 2.39
TROQ12816 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
TROQ12816 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC30■■■□□ 2.39
TROQ12816 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
TROQ12816 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TROQ12816 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TROQ12816 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TROQ12816 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TROQ12816 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TROQ12816 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
TROQ12816 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TROQ12816 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TROQ12816 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TROQ12816 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TROQ12816 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TROQ12816 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TROQ12816 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TROQ12816 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
TROQ12816 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TROQ12816 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TROQ12816 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TROQ12816 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TROQ12816 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TROQ12816 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
TROQ12816 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TROQ12816 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TROQ12816 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TROQ12816 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TROQ12816 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TROQ12816 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TROQ12816 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
TROQ12816 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TROQ12816 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TROQ12816 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TROQ12816 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TROQ12816 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TROQ12816 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TROQ12816 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TROQ12816 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TROQ12816 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TROQ12816 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TROQ12816 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TROQ12816 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TROQ12816 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TROQ12816 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TROQ12816 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TROQ12816 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TROQ12816 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TROQ12816 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TROQ12816 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TROQ12816 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TROQ12816 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TROQ12816 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TROQ12816 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TROQ12816 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TROQ12816 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TROQ12816 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TROQ12816 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TROQ12816 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TROQ12816 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TROQ12816 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TROQ12816 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TROQ12816 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TROQ12816 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TROQ12816 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
TROQ12816 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TROQ12816 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TROQ12816 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TROQ12816 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TROQ12816 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TROQ12816 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TROQ12816 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TROQ12816 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TROQ12816 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TROQ12816 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TROQ12816 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TROQ12816 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TROQ12816 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TROQ12816 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TROQ12816 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TROQ12816 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TROQ12816 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TROQ12816 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TROQ12816 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TROQ12816 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TROQ12816 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TROQ12816 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TROQ12816 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TROQ12816 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TROQ12816 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TROQ12816 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TROQ12816 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TROQ12816 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TROQ12816 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
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