Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC15Q0P6D6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms