Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPAL4Q0D2K0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms