Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD47Q08722 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD47Q08722 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD47Q08722 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD47Q08722 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD47Q08722 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD47Q08722 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD47Q08722 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD47Q08722 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD47Q08722 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD47Q08722 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD47Q08722 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD47Q08722 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD47Q08722 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD47Q08722 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CD47Q08722 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD47Q08722 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD47Q08722 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD47Q08722 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD47Q08722 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD47Q08722 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD47Q08722 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD47Q08722 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD47Q08722 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD47Q08722 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD47Q08722 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CD47Q08722 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD47Q08722 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD47Q08722 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD47Q08722 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD47Q08722 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD47Q08722 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD47Q08722 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD47Q08722 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD47Q08722 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD47Q08722 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD47Q08722 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD47Q08722 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD47Q08722 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD47Q08722 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD47Q08722 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD47Q08722 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD47Q08722 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD47Q08722 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD47Q08722 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD47Q08722 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD47Q08722 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD47Q08722 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CD47Q08722 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD47Q08722 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD47Q08722 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD47Q08722 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD47Q08722 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD47Q08722 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD47Q08722 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD47Q08722 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD47Q08722 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD47Q08722 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD47Q08722 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD47Q08722 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD47Q08722 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD47Q08722 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD47Q08722 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD47Q08722 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD47Q08722 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD47Q08722 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD47Q08722 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CD47Q08722 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD47Q08722 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD47Q08722 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD47Q08722 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD47Q08722 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD47Q08722 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD47Q08722 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD47Q08722 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD47Q08722 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD47Q08722 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD47Q08722 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD47Q08722 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD47Q08722 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD47Q08722 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CD47Q08722 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD47Q08722 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD47Q08722 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD47Q08722 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD47Q08722 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD47Q08722 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD47Q08722 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD47Q08722 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD47Q08722 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD47Q08722 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD47Q08722 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD47Q08722 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD47Q08722 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD47Q08722 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD47Q08722 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD47Q08722 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD47Q08722 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD47Q08722 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD47Q08722 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms