Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms