Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FMODQ06828 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FMODQ06828 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FMODQ06828 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FMODQ06828 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FMODQ06828 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FMODQ06828 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FMODQ06828 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FMODQ06828 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FMODQ06828 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FMODQ06828 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FMODQ06828 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FMODQ06828 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FMODQ06828 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FMODQ06828 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FMODQ06828 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FMODQ06828 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FMODQ06828 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FMODQ06828 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FMODQ06828 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FMODQ06828 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FMODQ06828 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FMODQ06828 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FMODQ06828 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FMODQ06828 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FMODQ06828 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FMODQ06828 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FMODQ06828 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FMODQ06828 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FMODQ06828 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FMODQ06828 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FMODQ06828 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FMODQ06828 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FMODQ06828 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FMODQ06828 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FMODQ06828 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FMODQ06828 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FMODQ06828 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FMODQ06828 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FMODQ06828 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FMODQ06828 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FMODQ06828 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FMODQ06828 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FMODQ06828 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FMODQ06828 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FMODQ06828 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FMODQ06828 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FMODQ06828 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FMODQ06828 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FMODQ06828 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FMODQ06828 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FMODQ06828 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FMODQ06828 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FMODQ06828 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FMODQ06828 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FMODQ06828 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FMODQ06828 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FMODQ06828 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FMODQ06828 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FMODQ06828 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FMODQ06828 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FMODQ06828 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FMODQ06828 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FMODQ06828 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FMODQ06828 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FMODQ06828 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FMODQ06828 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FMODQ06828 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FMODQ06828 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FMODQ06828 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FMODQ06828 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FMODQ06828 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FMODQ06828 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FMODQ06828 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FMODQ06828 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FMODQ06828 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FMODQ06828 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FMODQ06828 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FMODQ06828 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FMODQ06828 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FMODQ06828 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FMODQ06828 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FMODQ06828 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FMODQ06828 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FMODQ06828 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FMODQ06828 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FMODQ06828 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FMODQ06828 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FMODQ06828 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FMODQ06828 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FMODQ06828 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FMODQ06828 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FMODQ06828 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FMODQ06828 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FMODQ06828 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FMODQ06828 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FMODQ06828 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FMODQ06828 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FMODQ06828 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FMODQ06828 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms