Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms