Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF11Q05519 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF11Q05519 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms