Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC33.51■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ERCC6Q03468 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms