Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms