Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms