Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms